萌学园第五季讲述很久很久以前,一颗神奇的黑磁石落在夸克星球上，黑磁石拥有极其庞大的能量与不可思议的魔法能力,让原本好爱和平心地善良的夸克族人,分裂成两派族群。萌学园5异界对决时间设定在打倒暗黑的半年后。