《和谐Harmony》延续了《虐杀器官》的故事背景，讲述的是在《虐杀器官》的故事完结后又过了数十年，21世纪下半叶，经过被称作“大灾祸”的世界范围的动乱，人类实现了以医疗经济为核心的福祉社会，建立了每个人都“必须”亲密无间的乌托邦。人体内全都植入了微型医疗单元，它们无时无刻不在监视人体的健康状况，几乎所有的疾病都被消除。为了抵抗这样一个以所谓健全的道德伦理绞杀生命的世界，三个少女选择了自杀之路……