在很久以前，人类全都是住在海里的，可是，憧憬着陆地的人类最终抛弃了大海，他们脱去了那层海神所赐予的，能够让他们在海里生活的「胞衣」。登上陆地的那 些人遭受了种种的困难，日照持续不断，寻找水源的人类开始不断的互相争斗。有些人把这些恶果归结为「海神发怒了」的缘故，所以他们会把作为祭品的少女放在 船上，让其漂流向大海，这就是「舟曳祭」的来源。人鱼与人相互认识后，献祭品不是活人，而是米、点心之类的东西。相传生活在海里的水族，是海神与被献祭的 少女繁衍下来的子孙。由于水底学校关闭而被迫转入地上中学的爱花四人，在开学第一天邂逅了海边渔民家的孩子木原纺，一系列关于青春的故事就此开始。