独眼少年皐月驱在五年前一场不明原因的自杀中失去了唯一的姐姐。皐月驱从此一蹶不振，幸亏有和他一起长大的水奈瀬由佳的 照顾，皐月驱慢慢恢复了平静的心态，但是他从此对任何人和事都不再关心，对未来也不再抱有任何希望，终日浑浑噩噩的渡日。

就这样两人进入了新兴都市绫女丘 市虹陵馆学园就读，由佳一如既往的照顾着驱，两人的关系也再无进展，然而命运弄人，在毫无征兆的情况下，世界改变了。漆黑的月如墨一样照耀着大地，空中被 染上血色，街道上人的气息消失了，寂静包围了这个无人的废墟一样的世界。

在这个发生了翻天覆地变化的世界里，只有驱和由佳被笼罩在巨大的黑色月光底下，街 道上的异形蠢蠢欲动，驱和由佳除了逃跑别无选择。然而，在经过一个特定的时间之后，世界又恢复了原状。如此往复，“赤夜”的每次来临都毫无征兆。渐渐的， 驱和由佳发现除了他们之外，还有别的人也被卷入了“赤夜”之中。他们有的利用阴阳道击退敌人，有的利用超越人类的战斗能力打败异形。驱和由佳在“赤夜”相 遇的伙伴均是一些有着特殊能力的超能力者。

然而，他们将面对更强大的敌人——六个比起其他异形有着更强大战斗力的“黑骑士”。尽管驱和他的伙伴为着不同的 理由而战斗，然而在一起度过校园生活，一起共同战斗的过程中，渐渐的，驱和新的伙伴建立了不可取代的关系。经历了重重战斗，面对“赤夜”的真相，驱和他的 伙伴们究竟将如何选择……